Systém SÚIP v roce 2006 zaměří kontrolní činnost opět na stavebnictví, především na ochranu zaměstnanců před pády z výšky. Kontrolami stanoveného režimu řidičů se SÚIP připojí k Národní strategii bezpečnosti silničního provozu, dalším celorepublikovým úkolem jsou kontroly se zaměřením na malé a střední podniky. V neposlední řadě pak díky loňskému zákonu o inspekci práce bude předmětem kontrolní činnosti pracovněprávní oblast.